Δημοσιεύσεις

Εργασίες

13 άρθρα και ανασκοπήσεις σε περιοδικά με κριτές, καθώς και 1 προδημοσίευση. Οι τίτλοι παρατίθενται όπως δημοσιεύθηκαν, στα αγγλικά. Πλήρεις, πάντα ενημερωμένες λίστες υπάρχουν στο ORCID, στο Google Scholar και στο PubMed.

2026

• An ancestral tRNA maturation enzyme repurposed for cytoplasmic non-coding RNA processingShaukat A-N., Dondeti M.F., Maniatis A., Skeparnias I., Kaliatsi E.G., Anastasakis D.G., Zhang J., Vourekas A. and Stathopoulos C.
  bioRxiv (2026)Πρώτος συγγραφέαςΠροδημοσίευση · χωρίς κρίση ακόμηdoi:10.64898/2026.10.07.757187
  Η ανθρώπινη ELAC1 (RNase Z^S) δεν είναι απαραίτητη για την κανονική ωρίμανση των tRNA, αλλά προσδένεται σε δομημένα μετάγραφα της RNA πολυμεράσης III και κόβει απευθείας και τα τέσσερα vault RNA κοντά στο 3′ άκρο τους — ένδειξη εξειδίκευσης των δύο ανθρώπινων παραλόγων της RNase Z.
• PNLDC1 deadenylase affects translational rate and cell proliferation in mESCsSkeparnias I., Shaukat A-N., Katsioulas C., Anastasakis D., Grafanaki K., Chondrou V., Sgourou A., Zhang J., Papakyriakou A. and Stathopoulos C.
  RNA (2026) προδημοσίευση onlinedoi:10.1261/rna.081162.126
  Τα εμβρυϊκά βλαστοκύτταρα ποντικού χωρίς Pnldc1 παραμένουν πολυδύναμα αλλά μεταφράζουν λιγότερο· το γονίδιο αποσιωπάται με μεθυλίωση του υποκινητή κατά τη διαφοροποίηση, ενώ δύο ενώσεις που εντοπίστηκαν με εικονική σάρωση έναντι μοντέλου της PNLDC1 περιορίζουν τον παθολογικό πολλαπλασιασμό.
• Mitochondrial tRNA biogenesis, modifications and disease relevanceZhu W-Y., Skeparnias I., Shaukat A-N., Zhang J. and Liu R-J.
  Nat Rev Mol Cell Biol (2026) προδημοσίευση onlineΑνασκόπησηdoi:10.1038/s41580-026-00999-5
  Ανασκόπηση του τρόπου με τον οποίο τα μιτοχονδριακά tRNA ωριμάζουν, τροποποιούνται και αναγνωρίζονται από συνεξελιγμένες συνθετάσες και μιτοριβοσώματα, καθώς και της σχέσης τους με ασθένειες και νέες θεραπείες.

2025

• Conduits, Doppelgängers, and Chimeras: RNA Structures at the Virus–Host InterfaceShaukat A-N. and Zhang J.
  Annu Rev Virol (2025) 12(1):277–298Πρώτος συγγραφέαςΑνασκόπησηdoi:10.1146/annurev-virology-100422-031237
  Ανασκόπηση του πώς τα δομημένα ιικά RNA υπονομεύουν τον κυτταρικό μηχανισμό του ξενιστή — συχνά μιμούμενα κυτταρικά RNA («σωσίες») ή συνδυάζοντας χαρακτηριστικά πολλών RNA του ξενιστή («χίμαιρες»).
• Vault Particles in Cancer Progression, Multidrug Resistance, and Drug Delivery: Current Insights and Future ApplicationsManiatis A., Rizopoulou D., Shaukat A-N., Grafanaki K., Stamatopoulou V. and Stathopoulos C.
  Int J Mol Sci (2025) 26(4):1562Ανασκόπησηdoi:10.3390/ijms26041562
  Πώς τα σωματίδια vault και τα vault RNA συμβάλλουν στην εξέλιξη του καρκίνου και στην πολυφαρμακευτική αντοχή, και οι προοπτικές τους ως φορείς χορήγησης φαρμάκων.

2024

• Integrative analysis of circulating tumor cells (CTCs) and exosomes from small-cell lung cancer (SCLC) patients: a comprehensive approachPapakonstantinou D., Roumeliotou A., Pantazaka E., Shaukat A-N., Christopoulou A., Koutras A., Dimitrakopoulos F.I., Georgoulias V., Xagara A., Chantzara E., Koinis F., Kotsakis A., Stathopoulos C. and Kallergi G.
  Mol Oncol (2024) 19(7):2038–2055doi:10.1002/1878-0261.13765
  Σε 100 ασθενείς με μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα, τα JUNB, CXCR4 και PD-L1 στα κυκλοφορούντα καρκινικά κύτταρα και στα εξωσώματα αναδείχθηκαν σε προγνωστικούς δείκτες· τα JUNB/CXCR4-θετικά CTCs συσχετίστηκαν με χειρότερη επιβίωση.
• Recombinant Human TSH Fails to Induce the Proliferation and Migration of Papillary Thyroid Carcinoma Cell LinesKalampounias G., Varemmenou A., Aronis C., Mamali I., Shaukat A-N., Chartoumpekis D.V., Katsoris P. and Michalaki M.
  Cancers (2024) 16(14):2604doi:10.3390/cancers16142604
  Κλινικά σχετικές δόσεις rhTSH δεν προκάλεσαν πολλαπλασιασμό ή μετανάστευση κυττάρων θηλώδους καρκίνου του θυρεοειδούς, θέτοντας υπό αμφισβήτηση το σκεπτικό της επιθετικής καταστολής της TSH.

2023

• Integrated signaling and transcriptome analysis reveals Src-family kinase individualities and novel pathways controlled by their constitutive activityKoutras N., Morfos V., Konnaris K., Kouvela A., Shaukat A-N., Stathopoulos C., Stamatopoulou V. and Nika K.
  Front Immunol (2023) 14:1224520doi:10.3389/fimmu.2023.1224520
  Οι κινάσες Lck και Lyn δρουν σε επικαλυπτόμενα υποστρώματα αλλά ρυθμίζονται διαφορετικά· από μόνες τους πυροδοτούν γονιδιακή έκφραση τύπου ενεργοποίησης και ER-phagy σε Β-κύτταρα.

2022

• LRF Promotes Indirectly Advantageous Chromatin Conformation via BGLT3-lncRNA Expression and Switch from Fetal to Adult HemoglobinChondrou V., Shaukat A-N., Psarias G., Athanasopoulou K., Iliopoulou E., Damanaki A., Stathopoulos C. and Sgourou A.
  Int J Mol Sci (2022) 23(13):7025doi:10.3390/ijms23137025
  Ο μεταγραφικός παράγοντας LRF ενισχύει την έκφραση του lncRNA BGLT3, ανοίγοντας τη χρωματίνη και υποστηρίζοντας τη μετάβαση από την εμβρυϊκή στην ενήλικη αιμοσφαιρίνη.

2021

• The Dynamic Network of RNP RNase P SubunitsShaukat A-N., Kaliatsi E.G., Skeparnias I. and Stathopoulos C.
  Int J Mol Sci (2021) 22(19):10307Πρώτος συγγραφέαςΑνασκόπησηdoi:10.3390/ijms221910307
  Ανασκόπηση των πρωτεϊνικών υπομονάδων της RNase P — του ριβονουκλεοπρωτεϊνικού συμπλόκου που ωριμάζει το 5′ άκρο των tRNA — και των αναδυόμενων επιπρόσθετων ρόλων τους στα ανθρώπινα κύτταρα.
• Mitochondrial tRNA-Derived Fragments and Their Contribution to Gene Expression RegulationShaukat A-N., Kaliatsi E.G., Stamatopoulou V. and Stathopoulos C.
  Front Physiol (2021) 12:729452Πρώτος συγγραφέαςΑνασκόπησηdoi:10.3389/fphys.2021.729452
  Πώς θραύσματα που προκύπτουν από μιτοχονδριακά tRNA (mt-tRFs) υπό συνθήκες στρες, μετάλλαξης ή λοίμωξης μπορεί να λειτουργούν ως ρυθμιστές της γονιδιακής έκφρασης.

2020

• Functional and Structural Aspects of La Protein Overexpression in Lung CancerKaliatsi E.G., Argyriou A.I., Bouras G., Apostolidi M., Konstantinidou P., Shaukat A-N., Spyroulias G.A. and Stathopoulos C.
  J Mol Biol (2020) 432(24):166712doi:10.1016/j.jmb.2020.11.011
  Η υπερέκφραση της πρωτεΐνης La σε κύτταρα καρκίνου του πνεύμονα ενισχύει τον πολλαπλασιασμό και την κινητικότητα και μετατοπίζει τη μετάφραση προς IRES-εξαρτώμενη έναρξη· μελέτες NMR δείχνουν ότι το μοτίβο La αρκεί για τη δέσμευση pre-tRNA.

2017

• Expanding the repertoire of deadenylasesSkeparnias I., Anastasakis D., Shaukat A-N., Grafanaki K. and Stathopoulos C.
  RNA Biology (2017) 14(10):1320–1325doi:10.1080/15476286.2017.1300222
  Σχολιασμός για νεοταυτοποιημένες αποαδενυλάσες, όπως η PNLDC1, και τον ρόλο τους στη βιογένεση των piRNA, στη γονιδιακή ρύθμιση των βλαστοκυττάρων και στην επιγενετική.

2016

• Mammalian PNLDC1 is a novel poly(A) specific exonuclease with discrete expression during early developmentAnastasakis D., Skeparnias I., Shaukat A-N., Grafanaki K., Kanellou A., Taraviras S., Papachristou D.J., Papakyriakou A. and Stathopoulos C.
  Nucleic Acids Research (2016) 44(18):8908–8920doi:10.1093/nar/gkw709
  Η PNLDC1 είναι μια νέα poly(A)-ειδική εξωνουκλεάση που εκφράζεται σε εμβρυϊκά βλαστοκύτταρα, όρχεις και πρώιμα έμβρυα, και αποσιωπάται μέσω μεθυλίωσης από την DNMT3B.